城大有望将医学技术「空间组学」用于常规实践
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【大公报讯】记者姚高报道:生物医学技术「空间组学」(Spatial Omics)近年成为科研人员研究组织中分子的有效工具,例如了解分子在细胞、结构及局部微环境中的分布位置与组织方式。虽然如此,相关技术有多少可应用于常规临床实践始终构成疑问。香港城市大学研究团队,提出一种无需测序、无需扩增的组织空间分析方法「Spectrum-FISH」。该技术可直接应用于新鲜制备的组织样本,不需如现行技术需要对组织进行大量预先处理,为研究人员提供经济实惠、具广泛应用规模的方案。
纳米技术便利检测活体样本
研究团队由城大生物医学院生物医学工程学系教授史鹏领导,成果近日于《自然‧生物医学工程》期刊上发表,论文题为「新鲜组织中转录后调控的无测序空间分析」。
空间组学以分子种类与空间分布双重视角,正深化学界对癌症、神经生物学及免疫学的理解。团队指出,「Spectrum-FISH」技术建基于垂直排列纳米探针的「触碰即走」分子捕捞策略,属毋须测序、毋须扩增的组织空间分析方法,可直接应用于新鲜制备的组织样本,透过简单而有效的配准策略,研究人员可保留空间资讯,在组织结构原位分析单一细胞。相关美国专利已获批。
团队藉一系列实验,对象涵盖小鼠胚胎神经管与嗅球,以及新鲜的人类结直肠活检样本。团队着手探究能否降低对测序的依赖、简化组织处理流程及降低检测成本的同时,空间分析的解析度仍能提供充足的生物学资讯。结果显示,「Spectrum-FISH」技术适用于新鲜组织,亦毋须测序,既经济实惠又有广泛应用规模;其坐标保留式采样策略,也为活体或经最小程度处理的组织进行空间分析打开新的可能。此外,此技术能对信使RNA(mRNA)、微RNA(miRNA)及RNA甲基化进行分析,有望发展出较少依赖大规模测序基础设施的空间多组学分析。
史鹏表示,研究提醒我们,生物医学的创新不止要实现测量,更要令测量变得便利、实用。团队希望简化工作流程并降低成本,同时保留空间资讯,Spectrum-FISH展示空间组学技术如何更接近常规临床应用。

